孫飛 教授、博士生導(dǎo)師
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辦公地點(diǎn)：東南大學(xué)江北校區(qū)匯川樓B207
個(gè)人簡介：
孫飛，東南大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師、副院長，東南大學(xué)仲英青年學(xué)者。2009年畢業(yè)于山東大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，獲學(xué)士學(xué)位；2014年畢業(yè)于中國科學(xué)院微生物研究所，獲博士學(xué)位；2014-2021年在美國加州大學(xué)洛杉磯分校（UCLA）擔(dān)任博士后研究員和助理項(xiàng)目科學(xué)家；2022年加入東南大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院。
研究方向：三維基因組與基因調(diào)控
以Hi-C為代表的染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)的發(fā)展使人們對(duì)基因組的認(rèn)識(shí)進(jìn)入了3D水平。利用三維基因組技術(shù)重建的染色質(zhì)互作圖譜顯示，染色體在不同層次上形成各式各樣的三維結(jié)構(gòu)。這些結(jié)構(gòu)的紊亂雖然不會(huì)直接造成基因缺陷，但會(huì)使基因的表達(dá)產(chǎn)生異常并可能導(dǎo)致癌癥等一系列疾病的發(fā)生。本課題組以小鼠胚胎干細(xì)胞或癌細(xì)胞為模式生物，利用多組學(xué)手段，結(jié)合生物信息學(xué)，深入研究染色體三維結(jié)構(gòu)的功能和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的機(jī)理，具體研究內(nèi)容包括：（1）三維基因組與轉(zhuǎn)錄調(diào)控和致癌突變之間的相互關(guān)系；（2）反式作用因子（如RNA聚合酶及各種轉(zhuǎn)錄因子）在基因調(diào)控和癌癥發(fā)生過程中的功能；（3）新型組學(xué)方法和生物信息學(xué)分析工具的開發(fā)。
代表性論文：
1. Sun F, Sun T, Kronenberg M, Tan X, Huang C, Carey MF. (2021) The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter-enhancer looping. Genes & Development, 35(15-16): 1175-1189.
2. Sun F, Chronis C, Kronenberg M, Chen XF, Su T, Lay FD, Plath K, Kurdistani S, Carey MF. (2019) Promoter-enhancer communication occurs primarily within insulated neighborhoods. Molecular Cell, 73(2): 250-263.
3. Xue Y#, Pradhan S#, Sun F#, Chronis K, Tran N, Van C, Vashisht A, Wohlschlegel J, Peterson CL, Timmers HTM, Kurdistani SK, Carey MF. (2017) Mot1, Ino80C and NC2 function coordinately to regulate pervasive transcription in yeast and mammals. Molecular Cell, 67(4): 594-607. (#并列第一作者)
4. Sun F, Huang L. (2016) A euryarchaeal histone modulates strand displacement synthesis by replicative DNA polymerases. Science China Life Sciences, 59(7): 709-716.
5. Sun F, Huang L. (2013) Sulfolobus chromatin proteins modulate strand displacement by DNA Polymerase B1. Nucleic Acids Research, 41(17): 8182-95
6. Feng AC, Thomas BJ, Purbey PK, de Melo FM, Liu X, Daly AE, Sun F, Lo JH, Cheng L, Carey MF, Scumpia PO, Smale ST. (2024) The transcription factor NF-κB orchestrates nucleosome remodeling during the primary response to Toll-like receptor 4 signaling. Immunity, 57(3):462-477
7. Liu Q, Bischof S, Harris CJ, Zhong Z, Zhan L, Nguyen C, Rashoff A, Barshop WD, Sun F, Feng S, Potok M, Gallego-Bartolome J, Zhai J, Wohlschlegel JA, Carey MF, Long JA, Jacobsen SE. (2020) The characterization of Mediator 12 and 13 as conditional positive gene regulators in Arabidopsis. Nature Communications, 11(1):2798
